1.混沌宇宙，诸神为争夺宇宙核心力量之源的精神力，长久混战。

第一纪元
2.普罗米修斯创造由天、地和海洋组成的世界空间，并创造人类作为精神力的储存体。诸神通过人类的信仰而获得精神力，宙斯成为诸神的领导者。
3.普罗米修斯将魔法与科技传授给人类，在学习使用魔法与科技的过程中，人类中产生很多智者。
4.部分神和人类产生感情，半神诞生在世界上。
5.一些半神和人类中的智者利用神力和魔法为人类抵御灾害创造了奇迹，被人们膜拜，成为人类心中的先知、英雄。半神和智者们从人类的膜拜中获得精神力，最终上升成为新的神。
6.诸神对于半神与人类能成为神而感到不满，诸神之间的矛盾开始发生激发。
7.宙斯借口普罗米修斯盗取天火而囚禁了他，诸神间的矛盾显现。
8.诸神和新神对精神力需求的争夺，导致信仰和宗教极端化，人类之间也因此爆发各种战争，不同信仰之间爆发灭绝性屠杀。
9.哈迪斯的野心。人类对死亡的恐惧大大加强了哈迪斯的神力，哈迪斯萌发夺取宙斯地位的念头。哈迪斯利用神力将各种灾难降临人世间，人类大量的死亡造成众神对失去精神力的恐惧，并激化了众神间的争斗。
10.神直接加入到人类的战争中，世界进入黑暗时期，百年战争不断。宙斯发现哈迪斯的阴谋，但是此刻神力已经不如哈迪斯，宙斯的统治岌岌可危。
11.第一次诸神黄昏，神与神之间在大地上展开战争，天崩地裂导致第一次末日洪水淹没世界，人类大量死亡，随之众神的神力衰弱，最终结束了战争，哈迪斯的阴谋破灭了。宙斯为了保护奥林匹斯山，只好再次请求普罗米修斯帮助。

第二纪元
12.新世界诞生。普罗米修斯首先打造了潘多拉魔盒将代表哈迪斯神力的各种灾难封存，为了以防不测还将希望之力存在其中，并以宙斯的血作为魔盒的封印。然后，普罗米修斯以无尽海洋为底层将奥林匹斯山创造为一层层塔状结构，各个大陆以浮空岛的形式围绕在奥林匹斯山周围，杜绝了大陆间人类暴发战争，每个神守护单个大陆上的人类来获取精神力。最后，普罗米修斯将潘多拉魔盒藏在人类世界里。
13.神谕之灾。预言女神预言到有个半神会替代宙斯成为新的神王。这个预言在神界广为传播。宙斯为避免地位的动摇，夺取预言女神的双眼并囚禁了她。宙斯暗中对半神进行屠杀，神谕之灾正是指灭绝半神的这个黑暗时期。众多女神暗中保护一些半神，并将他们藏在人间。
14.波塞冬守护的亚特兰蒂斯，是唯一一个从末日洪水中保留下来的文明国度，科技高度发达，通过对能量水晶的运用，发明了飞空艇。波塞冬奉宙斯之命，派遣海怪破坏亚特兰蒂斯人的飞空艇，阻止他们对其它大陆的探索。亚特兰蒂斯人又发明了神翼和光能炮，击败了波塞冬的海怪，也是第一次人类打败了神的势力。从此飞空艇将各个大陆再次连接，亚特兰蒂斯将文明传播到其它大陆。
15.引导者的诞生。在击败波塞冬海怪战斗中诞生的英雄，自称为引导者成为了亚特兰蒂斯人的领袖，他提出人类应该摆脱神的统治，而深得民心，这引起了宙斯的不满。普罗米修斯主动请命调解，想说服引导者放弃违抗神的想法但没有成功。宙斯借机降罪普罗米修斯，再次囚禁了他并剥夺了他的神力，并流放了他的女儿潘多拉。而在人间，亚特兰蒂斯正为最鼎盛时期,引导者提出将亚特兰蒂斯建造为浮空岛，来摆脱神的统治，。
16.亚特兰蒂斯的覆灭。当亚特兰蒂斯发动升空的那天，宙斯指使人类世界最高统治神——奥丁带领人间众神向亚特兰蒂斯发起第一次神对人类的战争。最终奥丁使用永恒之枪击败了引导者并瓦解了他的神力。亚特兰蒂斯浮空岛的动力水晶遭到奥丁的破坏，发生了爆炸。亚特兰蒂斯瓦解坠落。众神又对亚特兰蒂斯文明展开屠灭，最终导致亚特兰蒂斯成为了传说，而那些先进的科技技术从此失传。只有少数亚特兰蒂斯人躲藏到其它大陆，隐居生存下来。
17.哈迪斯和阿瑞斯的密谋。新体系的世界一直和平发展，没有战争和灾难，大大削弱了战神阿瑞斯和哈迪斯的神力。于是哈迪斯和阿瑞斯密谋，准备里应外合推翻宙斯的统治。哈迪斯诱导流放的潘多拉前去寻找潘多拉魔盒以报父仇。
18.（游戏开始）潘多拉找到宙斯的私生子，同时又是引导者转世的半神佣兵。引诱佣兵来到亚特兰蒂斯残骸的神秘小岛。潘多拉制造假象，骗使佣兵杀死了守护的长老和村民，击败了守护者并打开了潘多拉魔盒。潘多拉现出原形并夺取了装有希望之力的希望水晶，于是灾难降临人间，哈迪斯重获力量。
19.哈迪斯发动冥界大军并得到阿瑞斯的协助，向人类各大陆发起突袭，破坏各个神殿，杀死信徒，削弱各个神的力量。哈迪斯模仿希望水晶制造了大量携带黑暗能的暗黑水晶散播到各个大陆。守护各大陆的众神因为失去神力而陷入恐慌，为了获得神力，守护神大量吸取暗黑水晶中的力量，并触发了内心中的黑暗面。暗黑水晶还影响了周围的生物，使它们暴躁、凶残和嗜血，各个大陆都陷入了黑暗之中。
20.暗中守护引导者转世的雅典娜，在危机时刻不得不出现在引导者面前，并指引引导者解决了阿瑞斯对雅典娜神殿造成的威胁。引导者赶在冥界大军之前进入了普罗米修斯在人间修建的天启神迹，获得神翼并回到了亚特兰蒂斯城的残骸中。
21.引导者在长老的指引下见到了逃离天狱的预言女神所化身的盲人占卜师，在她的指引下去各个大陆寻找回属于自己的各部分神力，才能对抗哈迪斯和阿瑞斯化解世界的危机。
22.引导者在各大陆寻找线索，消灭了被暗黑水晶控制了的生物，击败了被黑暗之心吞噬心灵的守护神，慢慢恢复了神力，并得知了宙斯为了违抗神谕而对半神所做的迫害。最终引导者击败了奥丁获得神力，从半神成为天神，击败了阿瑞斯和哈迪斯，解决了神界和世界的危机。
23.不可逆转的命运。神谕所预言的一切还是发生了。引导者从作为亚特兰蒂斯领袖时就要推翻神的统治，一直到现在发生的一切都是不可逆转的命运。引导者击败宙斯的各个守护神，最终击败了宙斯，成为神界新的神王。
24.新神王的诞生，并没有结束一切。宙斯的灭亡，新神王的诞生，让众神不满。同时哈迪斯的灭亡，导致被宙斯关押在地狱之下的泰坦古神摆脱了束缚。于是众神和泰坦古神向新的神王发起了挑战，第二次诸神黄昏就此爆发……